Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms