Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms