Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACHD1Q5VU97 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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