Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms