Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC38Q5VT99 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms