Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYDE2Q5VT97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms