Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRIP1Q5VSL9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms