Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOGA3Q5TF21 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms