Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN11Q5T124 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN11Q5T124 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN11Q5T124 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN11Q5T124 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN11Q5T124 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN11Q5T124 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms