Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms