Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUP188Q5SRE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms