Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FFAR4Q5NUL3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FFAR4Q5NUL3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms