Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SAMD9Q5K651 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SAMD9Q5K651 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms