Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms