Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITRM1Q5JRX3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms