Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF542PQ5EBM4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF542PQ5EBM4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms