Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDK2Q58EX2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms