Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms