Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A4Q53GD3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms