Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms