Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SBK1Q52WX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms