Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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