Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM30BQ3MIR4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms