Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD55Q3KP44 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD55Q3KP44 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms