Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms