Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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