Protein–RNA interactions for Protein: Q16851

UGP2, UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UGP2Q16851 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UGP2Q16851 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UGP2Q16851 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms