Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2B3Q16720 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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