Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PDK4Q16654 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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