Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP35Q16560 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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