Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SSX1Q16384 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SSX1Q16384 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SSX1Q16384 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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SSX1Q16384 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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SSX1Q16384 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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SSX1Q16384 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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SSX1Q16384 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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