Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK4Q16099 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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