Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZNF56Q15929 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZNF56Q15929 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF56Q15929 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms