Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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