Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN9AQ15858 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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