Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USF2Q15853 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USF2Q15853 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USF2Q15853 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USF2Q15853 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USF2Q15853 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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