Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA2Q15560 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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