Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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