Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCLAFQ15004 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms