Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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