Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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