Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMCO1Q147U7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO1Q147U7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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