Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF235Q14590 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF235Q14590 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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