Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARB2Q14108 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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