Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A2Q14055 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.33■■□□□ 1
COL9A2Q14055 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A2Q14055 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
COL9A2Q14055 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A2Q14055 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A2Q14055 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A2Q14055 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL9A2Q14055 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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