Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A6Q14031 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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