Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPSQ13938 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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