Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX39BQ13838 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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