Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP1Q13835 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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