Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALCAMQ13740 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms